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짧은 요약(Abstract) :    
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단어정리


Papers with my notes

[2021]DNABERT: pre-trained Bidirectional Encoder Representations from Transformers model for DNA-language in genome

짧은 요약(Abstract) :    
* DNA 유전체용 사전학습된 양방향 트랜스포머 인코더 모델 생성함  
** 유전자가 다의성과 의미적 관계가 서로 멀어서 굉장히 복잡했는데 DNABERT 통해 promoter prediction   확인  


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단어정리

  • deciphering: 풀다
  • polysemy: 다의성
  • promoter: 조절 유전자(오페론 전사 개시 부분)


[2023]DNABERT-2: EFFICIENT FOUNDATION MODEL AND BENCHMARK FOR MULTI-SPECIES GENOME

짧은 요약(Abstract) :    
* 효율적 기반 모델인 DNABERT-2 생성  다양한 종의 유전자에대한 밴치마크 제안  
** 기존 모델들은 k-mer이었지만 여기서는 BPE 토크나이저로 사용  
*** computation cost 줄어들고 sample inefficient 줄어듦  
** 유전체 이해 벤치마크 제공 - Genome Understanding Evaluation(GUE)  
** DNABERT보다 성능 향상  


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단어정리

  • intricacies: 복잡한
  • amalgamates: 합병하다